南京医科大学成立于1934年，时名江苏省立医政学院，是国内最早开展研究生教育的高等学府之一。1957年，学校更名为南京医学院。1962年，学校被列为全国首批六年制医药院校。1981年，学校被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，学校更名为南京医科大学。 

南京医科大学是江苏省属重点高校。目前，学校设有基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、药学院、护理学院、医政学院、第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院、鼓楼临床医学院、国际教育学院、继续教育学院和高等职业技术学院等13个学院和１个独立学院——康达学院。在南京、常州、无锡、苏州、淮安、杭州等地拥有18所附属医院和30多所教学医院。

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